Genomische Inzucht: Wie hoch ist sie in Schweizer Schaf- und Ziegenrassen?

Die Entwicklung moderner Technologien erlaubt es heute, mittels einer DNA-Genotypisierung den Zustand an Tausenden von Stellen im Erbgut eines Tieres aufzudecken. Diese Information kann verwendet werden, um die genomische Inzucht herzuleiten. Dies ist wertvoll für Populationen, die keine oder nur unvollständige Pedigree-Information haben. Weiter können Unterschiede in der Inzucht von Vollgeschwistern aufgezeigt werden und es kann sichtbar gemacht werden, wo im Erbgut Inzucht gewirkt hat. Dadurch liefert sie Anhaltspunkte zur genetischen Vielfalt innerhalb einer Rasse. In dieser Studie wurde für 1120 Schafe von elf Rassen und für 332 Ziegen von zehn Rassen die genomische Inzucht hergeleitet. Für die untersuchten Tiere der Ziegenrassen Saanenziege (SA), Toggenburgerziege (TO), Bündner Strahlenziege (BS), Walliser Ziegen (WZ), Appenzellerziege (AP) und Stiefelgeiss (ST), sowie der Schafrassen Walliser Schwarznasenschaf (SN), Spiegelschaf (SPS), Walliser Landschaf (WLS) und Ouessant Schaf (OUE) wurde eine durchschnittliche genomische Inzucht > 6,25 % berechnet. Generell erlaubt der Miteinbezug von genomischen Daten ein besseres Verständnis der Verwandtschafts- und Inzuchtverhältnisse in Schweizer Rassen. Dadurch sind differenziertere Entscheide für die Zucht und allfällige Erhaltungsaktivitäten möglich.

Lo sviluppo delle moderne tecnologie permette oggigiorno, tramite la genotipizzazione del DNA, di individuare migliaia marcatori genetici nel patrimonio genetico di un animale. Questa informazione può essere utilizzata per derivare la consanguineità genomica, che è molto utile per le popolazioni il cui pedigree è assente o incompleto. Inoltre, possono essere evidenziate differenze nella consanguineità tra fratelli pieni e può essere accertato dove la consanguineità abbia influenzato il patrimonio genetico. La consanguineità fornisce in tal modo indicazioni sulla diversità genetica all’interno di una razza. Nel presente studio è stata ricavata la consanguineità genomica di 1120 pecore appartenenti a undici razze e di 332 capre di dieci razze. Per gli animali esaminati appartenenti alle razze caprine Saanen (SA), Toggenburgo (TO), Striata grigionese (BS), Capre vallesane (WZ), Appenzello (AP) e Sangallese dagli stivali (ST), così come per le razze ovine Naso nero del Vallese (SN), Pecora dagli specchi (SPS), Roux du Valais (WLS) e Nana d’Ouessant (OUE) è risultata una consanguineità genomica media superiore al 6,25 %. In generale, la presa in considerazione dei dati genomici permette una migliore comprensione dei gradi di parentela e delle relazioni di consanguineità nelle razze svizzere e in tal modo rende possibili scelte più consapevoli nell’allevamento e in eventuali attività di conservazione delle razze.

The development of modern technologies now allows thousands of genetic markers in an animal’s genome to be revealed by means of DNA genotyping. This information can be used to deduce genomic inbreeding. This is valuable for populations that have no, or only incomplete, pedigree information. Furthermore, differences in the inbreeding of full siblings can be demonstrated and it is possible to identify where in the genome the inbreeding has had an effect. In this way it provides clues to genetic diversity within a breed. In this study, genomic inbreeding was investigated for 1,120 sheep from eleven breeds and for 332 goats from ten breeds. An average genomic inbreeding > 6.25 % between individual animals was observed in the goat breeds Saanen (SA), Toggen-burg (TO), Grisons Striped (BS), Valais goat (WZ), Appenzell (AP) and Stiefelgeiss (ST), as well as for the sheep breeds Valais Blacknose (SN), Spiegel (SPS), Roux du Valais (WLS) and Ouessant (OUE). In general, the consideration of genomic data allows a better understanding of kinship and inbreeding conditions in Swiss breeds and therefore enables better decision-making in relation to breeding and possible conservation activities.